囤房稅2.0將加重多屋族稅負，據財政部目前設計的課徵參考基準，針對不屬於繼承共有、也沒有出租做有效利用的「非自住」住家用房屋，六都適用稅率擬3.2%起跳、非六都2.8%起跳。

另外，財政部也將考量城鄉差距，提出課徵基準給地方參考，如果縣市訂得比財政部基準更寬鬆而有稅損，中央將不予補貼。

根據財政部現階段設計的課徵參考基準，將全台22縣市分為3大組。六都直轄市為第1組；宜蘭縣、新竹縣、苗慄縣、彰化縣、雲林縣、屏東縣、新竹市為第2組；南投縣、嘉義縣、台東縣、花蓮縣、澎湖縣、基隆市、嘉義市、金門縣、連江縣，屬於第3組。

若在宜蘭縣等7縣市（第2組），持有1戶「非自住」住家用房屋，適用稅率2.8%；2至4戶稅率3.2%；5至6戶稅率3.8%；7戶以上稅率4.8%。

如果在南投縣等9縣市（第3組），持有2戶以內非繼承、非出租的「非自住」住家用房屋，適用稅率2.8%；3至5戶稅率3.2%；6至7戶稅率3.8%；8戶以上稅率4.8%。

此外，出租或繼承共有房屋方面，在六都持有3戶以內，適用稅率1.5%；4至5戶稅率2%；6戶以上2.4%。在宜蘭縣等7縣市（第2組），持有4戶以內，稅率為1.5%；5至6戶稅率2%；7戶以上稅率2.4%。在南投縣等9縣市（第3組），持有5戶以內，稅率1.5%；6至7戶稅率2%；8戶以上2.4%。

舉例來說，囤房大戶A先生在台北市、新北市、台中市、基隆市，分別擁有3間不屬於繼承共有、也沒有出租的「非自住」住家用房屋，全台一共12間。

新制實施後，上述每屋都將適用12戶對應的稅率，在雙北與台中市（第1組）的9間房，將均適用4.8%稅率；基隆市（第3組）3間房適用稅率也是4.8%。不過，若12間全數出租並誠實繳稅，適用稅率一口氣降至2.4%。

根據《經濟日報》，元宏不動產加值服務平台總監陳傑鳴指出，依內政部統計，到去年底5年內，全國未售出新建餘屋達8萬2,307宅，囤房稅如果真的上路，影響最大的應會是這些建商，房屋稅將大大增加，在成本大增的狀況下，可能會求降價出清，不過也有可能因此跑路或倒閉，專家提醒欲購屋者要特別注意。